各社康举办医院要建立健全独立的社区健康服务财务核算体系，并根据实际运行情况进行全面测算，实施总量控制、全额预算制管理的预算模式。在医院总账下建立社康财务分账户，各级政府投入及社康中心收入直接划拨到社康账户，社康收支实行统一管理，其经费与医院严格划分，自主管理，独立实行成本核算。
　　2、实行全成本核算
　　以社区健康服务机构为核算单元，设置独立的社康财务成本账簿，对社康中心进行收支核算，按要求编制社康中心收支核算报表。社康机构的所有收入和支出均纳入年度预算管理，按照成本核算的要求分别核算各社康中心的各项收入及支出。对社康机构与医院之间存在的业务联系和财务来往，实行完全的成本核算，包括建设经费与低值易耗品等各方面的成本核算。社区健康服务机构全成本核算办法由各区根据实际情况制定并组织实施。
　　3、加强监督管理
　　医院社管中心配备专职会计与出纳人员，负责统一核算与财务管理。加强对经费核拨、使用等方面的监督管理，政府各项政策性投入要确保纳入社区健康服务收入管理，并保证各项投入专款专用。社康机构要严格遵守财务管理规范，接受区卫生行政部门统一监管，并定期进行公布，接受外部监督。
　　（三）创新运行机制
　　1、人事制度改革
　　推行社区健康服务人事制度改革，实现竞争上岗。社区健康服务工作人员实行聘用聘任制，由医院社管中心负责使用、考核、聘任和管理，区卫生行政部门负责指导与监督。做好人员配置规划，实行人员定编定岗，按照市政府及上级行政部门有关文件精神落实人员配置。
　　2、分配机制改革
　　改革社区健康服务中心工作人员的绩效工资分配机制，建立社区健康服务中心科学的分配制度。完善激励机制，逐步改善社区健康服务中心工作人员的福利待遇和工作环境，稳定社区人才队伍。探索实行以岗定薪的工资核算办法。
　　改变员工收入结构，在编人员与聘用人员的绩效工资与福利实现同工同酬。绩效工资与机构的服务收入不直接挂钩，由服务完成的质量与数量、服务对象满意度等因素确定，从根本上切断社区医务人员利益链，避免社康中心的趋利行为，有效保障社区健康服务的公益性。工作绩效考核评估标准由各区卫生行政部门研究后确定。
　　3、物流管理改革
　　调整药品、耗材及其它非核心性业务服务的采购与配送办法、逐步建立并实行统一采购、集中配送制度。按照《深圳市社区基本药物目录（2010版）》及安全、有效、价廉的原则，确定社区用药的品种、规格及价格等。在当前阶段，耗材、后勤物资等可充分利用医院原有的条件和资源进行统一采购，医院与社区健康服务中心之间实行全成本核算。逐步建立社康区域性医学检验中心，实行“社区取样、中心检测、结果返还”的检验流程及远程影像学诊断，检验结果实现网上传送，以方便患者、节省资源，提高诊断质量。

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