第二十七条 水利部根据与财政部共同批复的规划，负责审核批复各省年度治理任务，财政部、水利部根据 批复的各省年度治理任务和资金预算，研究提出资金分配方案，按程序报批后，将水土保持专项资金拨付有关省级财政部门。
第二十八条 项目区县级财政、水利（水保）部门依据批复的规划和年度建设任务，以小流域为单元组织编制初步设计报告，逐级上报省财政、水利部门审批后组织项目实施。
第二十九条 治理区内县级财政、水利（水保）部门要明确落实项目工程产权和管护责任，确保建成一处，落实一处。各设区市财政、水利（水保）部门要发挥监督指导作用，推动工程产权的落实和管护机制的建立，促进长效运行管护机制建设。
第四章 资金监督检查
第三十条 小农水和水土保持专项资金项目要按照公开透明的原则，实行公示制。县级财政、水利部门要采取适当的形式，将年度项目实施情况在当地及时进行公示，资金使用、筹资筹劳等情况应向受益区农民及时张榜公布，接受群众监督。
第三十一条 各级财政部门要及时拨付小农水和水土保持专项资金，保证建设工程和项目的顺利实施。要大力推行县级报账制、大宗物品政府采购制，具备条件的地方应积极实行国库直接支付制度。
第三十二条 各级财政部门、水利（水保）部门要建立和健全资金监管体系，加强小农水专项资金、水土保持专项资金的使用管理和监督检查，保证专款专用。积极配合有关部门做好审计、稽查等工作。
第三十三条 各级水利（水保）部门负责项目规划、设计、建设管理和技术指导，督促落实工程建成后的经营和管护责任。县级水利部门要加强项目建设管理，建立和完善由项目法人或业主负责的建设和管护机制，加强产权制度改革，明确产权归属。
县级财政、水利（水保）部门要加强项目建设的日常监管，掌握项目建设进度，发现问题及时纠正。省财政厅、水利厅对项目建设情况要采取随机方式进行抽查监督。
第三十四条 各市（县、区）财政、水利（水保）部门要建立健全项目管理和资金使用情况统计报告制度，于每年3月15日前向省财政厅、省水利厅报送上年项目实施和资金使用情况。
