上海市医院对口支援云南省县级医院工作领导小组由市卫生局、市财政局领导及相关处室负责人组成。领导小组下设办公室，负责具体落实对口支援工作方案，协调与云南省卫生厅、各办医主体（医院上级主管部门）、各医疗机构的关系，收集、报送相关信息，对对口支援日常工作开展检查评估并完成领导小组交办的其它任务。
各办医主体（医院上级主管部门）应设立相应的组织架构，明确分管领导，负责组织所属医院的对口支援工作，制定各系统对口支援的工作规划、方案，配合市卫生局协调支援受援双方建立稳定的对口支援关系，并督促所属医院做好各项支援日常工作。
第五条 根据市卫生局制定的对口支援工作规划和方案，对口支援工作所需工作经费、重点（特色）科室建设经费补助由市财政统筹安排；人员经费补助按支援医院现行财政管理体制由市区县财政根据人事部门确定的标准予以核拨。
第三章 上海市支援医院的职责与任务
第六条 上海市支援医院应当明确负责对口支援工作的主管领导和具体负责人员，设立专门的工作机构，与上海市医院对口支援云南省县级医院工作领导小组及办公室保持联系，及时沟通工作中遇到的问题，及时上报每月、季度、年度有关对口支援的工作简报、信息以及计划、总结等。
第七条 上海市支援医院应当与受援医院签订对口支援协议，明确对口支援的年度和中长期目标、任务内容、支援方式、双方的权利和义务等，制订工作计划和方案并切实履行。
第八条 上海市支援医院应当首先开展针对受援医院的基线调查，摸清基本情况，为将来的考核评估做好准备。并针对医院的实际和当地群众的需求，帮助受援医院培养一批骨干和科室带头人，建设一批特色和重点科室，提高医院服务能力和管理水平。
第九条 上海市支援医院应当每批选派5名以上以高年资主治医师以上为主的经验丰富的医务人员参加对口支援工作，医务人员专业以医疗为主，兼顾护理、医技和其它方面，每批队伍应由一名专职或兼职的管理人员担任领队。具体专业、批次等可与受援医院协商确定。在确保支援工作的持续性和稳定性的前提下，医务人员可定期分批轮换，但每批连续工作时间不得少于六个月。
