第六条 区（县）财政部门在社会保障基金财政专户中设立基金专账（以下简称“财政专户”），专门管理和核算基金。基金纳入财政专户，实行收支两条线管理，专款专用。任何部门、单位和个人均不得挤占、挪用，不得用于平衡财政预算，不得用于经办机构人员和工作经费。
第七条 经办机构应配备取得会计从业资格证书的专职财务会计人员。财务会计人员应按照基金财务会计制度的相关规定做好财务管理和会计核算工作，准确反映基金运行情况，监督基金的安全、有效使用。财务会计人员发生变更时，应按照有关规定做好交接工作。
第二章 基金预算
第八条 基金预算是指经办机构按照新农合制度和管理政策编制的、经规定程序审批的年度基金财务收支计划。
第九条 基金预算的编制。每年10月底前，经办机构应按照收支平衡、略有节余的原则和财政部门规定的表式（附1）、时间和编制要求，根据本年度基金预算执行情况和下年度影响基金收支的相关因素，编制下年度基金预算草案。
第十条 基金预算的审批。经办机构编制的年度基金预算草案，由区（县）卫生行政部门审核汇总，经区（县）财政部门审核并报经区（县）政府批准后，报市级管理机构备案。区（县）财政部门应在区（县）政府批准后15日内及时向区（县）卫生行政部门批复预算。区（县）卫生行政部门应在区（县）财政部门批复预算之日起15日内将预算批复经办机构。
第十一条 基金预算的执行。经办机构要严格按照批准的预算执行，并认真分析基金的收支情况，每季初按规定的表式（附2）向区（县）卫生行政部门和财政部门、市级管理机构报告上季预算执行情况。
市级管理机构要加强对基金预算执行情况的监控，发现问题立即报告市财政部门和市卫生行政部门，并督促区（县）财政部门和区（县）卫生行政部门采取措施及时解决。
第十二条 基金预算的调整。遇特殊情况需调整基金预算时，经办机构要及时编制预算调整方案，并按基金预算编制审批程序报批。
第三章 基金筹集
第十三条 按照本规定，按时、足额筹集基金。区（县）财政部门应根据本市新农合有关政策安排补助资金，纳入区（县）财政年度预算并按规定程序及时拨付；市财政按照市政府规定的补助标准对困难区县等予以补助。镇（乡）政府应组织参合农民按本市规定的缴费标准缴纳参合费用。五保户、低保户、特困户等人员的个人缴费减免，按照本市有关规定执行。任何地区、部门、单位和个人不得截留和擅自减免。
