六、结合西气东输、西电东送和南水北调等跨区域、跨流域大型建设项目的实施，开展区域、流域环境影响评价试点工作。结合西部生态环境现状调查、生态环境功能区划及生态环境保护规划等工作，对主要环境问题、污染物总量控制目标、自然资源合理利用、生态环境保护和恢复做出评价，提出综合决策建议。
七、在建设项目环境管理中，应加强自然保护区、江河源头区、重要水源涵养区、江河洪水调蓄区、防风固沙区、水土保持的重点预防保护区和重点监督区、重要渔业水域、湖泊湿地区、荒漠绿洲区等区域生态功能的保护，停止一切导致生态功能退化的开发建设项目；加强水资源、土地资源、林草资源、野生物种资源、景观资源和历史文化遗产的保护以及资源开发的生态保护监督管理。对确实无法避免的影响，应提出和落实补偿性措施，占用生态用地的，实行“占一补一”的制度，确保恢复面积不少于占用面积。
八、严禁在自然保护区的核心区、缓冲区进行旅游开发。在自然保护区实验区进行的旅游开发，应注重评价游客数量增加、旅游设施建设和旅游线路开发对生态环境的影响，提倡“区内旅游区外住”，合理设计旅游路线，确保旅游设施建设与自然景观相协调，维持自然保护区的自然本色和生态功能。
九、自然资源的开发和植树造林、水土保持、防沙治沙、草原建设等重大生态环境建设项目必须开展环境影响评价。评价中应注重水资源的合理配置及利用、生物多样性保护、外来物种入侵防范、水土保持、防止土地盐渍化等生态环境问题的评价分析。加强农村畜禽养殖场建设环境影响评价，严防农村非工业点源污染。
十、在青藏高原区的“江河源”等生态功能区应禁止任何导致生态功能严重退化的开发建设活动；牧业开发应避免盲目引种和超载过牧，确保生物安全，防止草场退化；禁止盲目垦荒，防止土地退化；严格控制新建对生态环境影响较大的矿业开发项目；水利水电及交通项目的选址和选线应注意对生物多样性、自然景观、生态脆弱地带、历史文物古迹的保护。
十一、在干旱、半干旱区严格控制开荒及增加引水量的农业开发项目，停止新上高耗水项目；在水生态问题突出的地区，停止新的加重水平衡失调的蓄水、引水和灌溉工程。发展节水灌溉及高效农业项目；引水、农田灌溉等水利项目环境影响评价中应重视流域水资源平衡，坚持“以水定规模”的原则，保护流域水质和保证生态用水，防止土地盐渍化；在矿业开发、石油天然气勘探和开采、交通及管道运输等项目的建设中，应保护地下水源，减小开挖面积，边施工边恢复；在干旱、半干旱地区采用生物与工程措施相结合的方式，防止水土流失。
