三、组织形式、股本结构、出资方式及来源
1.组织形式：整体转制成由院和研究所在职职工出资组建的有限责任公司。职工股由职工持股会管理。
2.股本结构：院占60%，职工持股会占40%。
3.出资方式及来源：
(1)中国科学院院方
以2000年3月31日为基准日，对研究所的全部资产(包括土地使用权、科研办公用房的产权和知识产权)进行评估，以经国家有关部门确认后的净资产额作为出资。
对折股投入的这部分房地产，公司要与院的土地管理部门签定协议，由公司承诺，公司对这部分土地的开发建设要符合院科研园区的整体规划。当院的科研园区建设需要使用这部分土地及其地上房产，或在公司出现重大经营危机时，院优先用现金或其他资产以当时的价格购回，尽量保持院园区规划的完整。
(2)职工持股会
①研究所在职职工投入部分现金。
②现金股不足公司股本40%的部分，作为公司职工的期权股。自2000年起的10年内，公司职工每年除按现金股份比例分得利润外，还享有公司经审计的可供分配利润35%的分红权，分红权所得红利用于购买相应的期权股。
到期未能购完的股份，仍留作公司的期权股，职工以现金购买。
四、组织机构
公司建立由股东会、董事会、监事会及经营管理层组成的法人治理结构。
股东会是公司的最高权力机构，由院和职工持股会组成。
董事会是公司的决策机构，由7名董事组成。董事由股东按出资比例选派。董事长为公司的法定代表人，由院选派的董事出任董事长。
院派董事按《中国科学院技术开发公司董事管理条例》(科发企字[1996]0215号)的规定进行管理。
监事会是公司的监督机构，由3名监事组成，其成员应有职工代表。监事会设监事会召集人1名，由院选派的监事出任。董事、经理及财务负责人不得兼任监事。监事派代表列席董事会。
总经理、副总经理及财务负责人由董事会聘任。
五、属于院事业编制人员的社会保障问题
1.原有事业费数额不变，按专项基金方式继续拨付，主要用于解决2000年6月30日之前已经离退休人员的社会保障问题。在国家建立事业单位离退休人员保障制度之前，原离退休金的计发办法不变。离退休人员离退休金的发放和日常管理由原单位负责。
