国家投资项目管理实行中央与地方分级负责机制。部主要负责制定政策和技术规范，发布项目指南，受理入库项目备案，审查项目初步设计与预算，下达项目计划，开展项目监督检查。省级国土资源部门主要负责落实国家政策与任务，组织项目申报，负责项目入库审查和项目库建设，核准项目实施方案，监督指导项目实施，开展项目竣工验收。各地要适应管理职责变化需要，根据工作任务的要求，明确责任，充实人力，保证职责到位。部将进一步强化项目监督检查，不定期通报各地国家投资项目库建设，项目实施的工程质量、进度，资金使用管理、制度执行和项目竣工验收等情况，对存在的问题限期整改。
为强化项目管理技术保障，要逐步完善国家和省级土地开发整理项目管理专家库，依靠专家力量，对项目审查、实施监督检查和竣工验收等提供咨询、评估、论证服务，提高项目决策和管理的科学化、民主化水平。项目可行性研究报告、设计与预算的编制等要逐步引入市场竞争机制，促进土地开发整理社会化、市场化。
五、切实做好有关工作，发挥土地开发整理综合效益
土地开发整理是改善农业生产条件和生态环境，提高农业综合生产能力，促进农业增产、农民增收、农村发展的重要手段。各级国土资源部门要切实做好项目管理中各环节的有关工作，规范土地开发整理行为，充分发挥土地开发整理的综合效益。
项目前期可行性研究要深入实地充分论证，确保经济、社会和生态效益；初步设计和施工图设计要符合实际，切实可行，严禁脱离实际的“形象工程”和随意变更设计行为；项目选址、论证和设计，要吸收当地群众参与并尊重群众意见。项目实施过程中要认真执行项目法人制、招投标制、工程监理制、公告制和合同制等制度，严禁假招标、假监理、假合同等行为，保证工程进度和质量。项目建设完成后，要高度重视后期管护工作，按照谁使用谁管护的原则，建立责任制，落实工程管护措施，严禁只用不管、破坏工程设施等行为，确保工程长期发挥效益。
在项目实施过程中，各有关单位要加强资金使用管理，硬化预算约束。严格执行专款专用、专项管理、单独核算规定，任何单位和个人不得超支出范围和标准开支，更不得截留和挪用项目资金；要建立、健全项目会计核算和内部稽核制度，对项目资金实行全过程的财务管理与监督；要严格项目资金竣工决算，规范项目的业绩考评和追踪问效。
在土地开发整理中要切实加强土地权属管理工作。严格按照有关要求和规定程序办事，涉及土地权属调整的，要在充分尊重农民意愿和原有产权的基础上，根据土地利用规划、乡村和农田建设的需要，依法、合理调整土地权属，及时办理变更土地登记，保证农户相对集中使用土地，降低生产经营成本，促进农民增收。各级国土资源部门要充分认识权属管理工作的重要性，切实把工作做细、做实、做好，避免发生新的土地权属争议，维护农村社会稳定。
