科技部批复《国家工程技术研究中心组建项目可行性论证报告》（附件二），编制国家工程中心组建项目计划。主管部门根据科技部的批复意见，组织填报《国家工程技术研究中心组建项目计划任务书》（附件三）。
五、资金来源及管理
国家工程中心组建资金的主要来源为：国拨经费、地方或部门配套经费、依托单位自筹经费。其中，国家拨款主要用于购置工程技术研究开发所必需的仪器、设备及引进必要的技术软件；国家工程中心基本设施建设所需资金，由主管部门和依托单位配套解决。国家工程中心组建经费实行独立核算，每年应按国家有关规定编报年度预算。
国家拨款须严格遵循国家有关资金管理办法和财务制度，实行专款专用，严禁截留、挪用和挤占。国拨经费添置的仪器设置等统一纳入国有固定资产渠道，依法管理。
六、国家工程中心的实施与监督检查
（一）国家工程中心组建期间的实施与监督检查
国家工程中心采取边组建、边试运行的工作方式，组建期限一般为3年。依托单位应严格执行《计划任务书》，完成组建项目目标任务。主管部门及依托单位应根据《计划任务书》落实资金和各项保证条件，确保组建工作顺利进行。
应根据实际需要，由主管部门和依托单位有关负责人组成组建领导小组，从组织措施上确保组建工作顺利进行。组建期间，应成立由依托单位和有关成员单位负责人以及主管部门共同组成管理委员会，负责制定国家工程中心发展方向、规划、计划，协调成员单位及相关合作单位间的关系；应设立由同一行业权威人士及依托单位主要骨干组成的工程技术委员会，提供咨询服务等。
国家工程中心实行主任负责制。主任的任免决定由依托单位做出，并报主管部门和科技部备案。
国家工程中心应当是独立实体，并可根据实际情况选择发展模式，参照现代企业制度，健全人员、财务、资产、分配、考核等方面的管理制度。
由于各种原因需调整组建考核目标时，依托单位应将调整方案及调整原因通过主管部门上报科技部批准。因客观原因不能继续实施组建计划或撤销立项应停止下拨余留经费，并酌情收回国家有关投资或调出有关仪器设备。
组建项目完成后，科技部以科技评估和综合评议相结合的方式对国家工程中心进行验收。对验收通过的正式授予“国家工程技术研究中心”名称，颁发统一制作牌匾；对验收未通过的，责成依托单位采取措施作出改进，两次验收未通过者则终止组建。
