要加强国家工程中心运行机制建设。按照体制创新、科技创新思路，继续进行国家工程中心管理体制、运行机制等方面的建设，探索符合市场经济规律要求和科技自身发展规律的科技成果工程化、产业化新途径，促进国家工程中心健康、快速发展。同时，建立和健全国家工程中心的竞争机制、评价机制、监督机制和激励机制，对国家工程中心实行动态管理。
三、组织管理机构及其职责
科技部负责国家工程中心的组织管理。编制国家工程中心的总体发展规划，明确优先发展领域，制定相关政策措施等；编制下达并组织实施组建项目年度计划，检查有关执行情况；组织国家工程中心的验收及定期运行考评和分类管理。
国务院有关部门或地方科技行政主管部门（以下简称主管部门）负责国家工程中心的具体组织实施与协调管理。根据发展规划，组织本部门（或地方）的国家工程中心组建项目的申报工作，并根据发展需要，组建本部门（或地方）的工程中心；具体负责归口管理本部门（或地方）的国家工程中心的组建实施，并提供必要的配套经费；检查本部门（或地方）国家工程中心的执行情况，监督有关组建经费的使用，协调解决组建及运行期间存在的相关问题；协助国家工程中心在行业或地区经济发展和技术进步中发挥作用。
四、立项条件及程序
（一）申请承担国家工程中心组建任务的单位应具备以下条件：
已组建省、部级相同领域工程中心，并已运行一年以上；在相关技术领域具有雄厚的研究开发实力，在国内同行业或同领域中技术领先，在国际上有一定影响；具有技术创新、产业化意识较强和管理水平较高的领导班子；具有学术水平高、工程化实践经验丰富的工程技术带头人，拥有一定数量和较高水平的工程技术研究开发人才，有能够完成工程试验任务的熟练技术工人，有经验丰富勇于开拓的营销人才；基本具备工程技术试验条件和基础设施，有必要的检测、分析、测试手段和工艺设备；拥有较雄厚的经济实力，有筹措资金能力和良好信誉；密切联系一批企业和科研院所，并有良好的合作关系，有接受科技成果进行工程化转化和向企业辐射工程技术成果的成功经验。
（二）国家工程中心立项程序
科技部制定国家工程中心总体发展规划。根据工程中心发展规划，具有组建资格并愿意承担工程中心组建任务的单位，向主管部门提出并按格式填报《国家工程技术研究中心组建项目建议书》（附件一）。主管部门在严格审查的基础上，择优推荐并向科技部申报。
科技部相关专业司受理项目建议书，并提出审查意见。经科技部发展计划司初审，提出初步立项名单后，开展可行性论证。主管部门组织申请单位进行可行性研究；科技部相关专业司组织同行专家进行可行性论证；科技部发展计划司组织技术、经济、管理等方面的专家对可行性报告进行综合评审，并提出组建建议。
