（二）改革的方向。
对不同类型、分属不同部门的科研机构实行分类改革：
１．技术开发类科研机构实行企业化转制。
国家电力公司、中国石油化工集团公司、中国石油天然气集团公司、中国建筑工程总公司、中国汽车工业总公司等企业所属科研机构已经进入企业，要办理事业单位注销手续；作为独立企业法人的要办理企业登记手续。
建设部、铁道部、交通部、信息产业部、药品监管局等部门所属技术开发类科研机构，要通过转为企业或进入企业等方式向企业化转制，与原部门脱钩；为国家经济和社会发展提供重大基础性或共性技术服务、无法得到相应经济回报的个别科研机构，通过调整结构、优化组合形成一支精干队伍，这些科研机构可以由原部门（单位）继续按事业单位管理。承担军事科研任务的科研机构，原则上也要向企业化转制，具体转制方式和管理体制另行制定。
２．社会公益类科研机构分别不同情况实行改革。
国土资源部等部门所属公益类研究和应用开发并存的科研机构，有面向市场能力的（占总数一半以上）要向企业化转制；以提供公益性服务为主的科研机构，有面向市场能力的也要向企业化转制；主要从事应用基础研究或提供公共服务、无法得到相应经济回报、确需国家支持的科研机构，仍作为事业单位，按非营利性机构运行和管理，其中具有面向市场能力的部分，也要向企业化转制并逐步与原科研机构分离。其他科研机构要向中介服务方向发展。
按非营利性机构管理和运行的科研机构，要优化结构、分流人员、转变机制，按照总体上保留不超过３０％工作人员的要求，重新核定编制。
３．财政部、文化部等部门所属以社会科学（含经济、文化、法律等）领域研究为主的科研机构，按照国家关于其他类型事业单位的改革部署进行改革。
４．中科院所属科研机构，按照本实施意见确定的基本原则进行改革。具体工作要结合经国务院批准的“知识创新工程”试点方案进行。
５．加强科研和教育的结合，鼓励科研机构进入高等学校、与高等学校合并或开展多种形式的合作。
二、支持科研机构深化改革的政策
（一）转为企业或进入企业的科研机构，执行科技部等部门发布的《
关于国家经贸委管理的１０个国家局所属科研机构管理体制改革的实施意见》（国科发政字〔１９９９〕１４３号）、《关于国家经贸委管理的１０个国家局所属科研机构转制中有关国有资本核定问题的通知》（财管字〔１９９９〕２７６号）、《关于国家经贸委管理的１０个国家局所属科研机构转制后税收征收管理问题的通知》（国税发〔１９９９〕１３５号）、《
关于国家经贸委管理的１０个国家局所属科研机构转制后有关养老保险问题的通知》（劳社部发〔２０００〕２号）中所规定的政策。涉及实施时限的，由发文单位作相应的变通处理。
