（三）查处了一批违法违纪案件。各地大检查统计结果表明，１９９９年全国共查结７５０７起涉及农民负担案件，受到党纪政纪处分的干部４８００人。１９９９年发生的恶性案件，大部分得到了处理。
（四）完善了各项监督管理制度。各地通过大检查，进一步完善了减轻农民负担工作党政一把手负总责的制度，明确了部门专项治理责任制度，加强了农民负担监督管理的预决算、监督卡、专项审计和财务公开制度建设。这些制度的完善和健全，为下一步加强对农民负担的监督管理奠定了良好基础。
二、存在的主要问题
从各地检查上报和我们抽查的情况看，减轻农民负担工作仍存在不少问题：
（一）一些地方的检查工作还不够扎实。在乡镇自查中，有的乡镇检查工作要求不严、标准不高；有的乡镇认为当地负担不重，检查流于形式；有些乡镇担心大检查认真开展起来会自找麻烦，没有进行检查。在县级全面检查中，有的县没有真正按照国务院要求的检查内容逐项进行检查，有的县借口人手少、时间紧，认为检查组只要到了所辖乡镇就完成任务了。还有不少地方的部门自查自纠走了过场，没有取得应有效果。总的看，大检查工作存在三个不平衡：一是地区之间不平衡，领导重视、减轻农民负担机构比较健全的地方力度大些，相反就小些；出了恶性案件的地方力度大些，没有出事的地方力度小些。二是上下之间不平衡，省、地两级党委和政府比较重视，动作较大也较快，县、乡两级有的没有完全按照中央和上级精神开展大检查，约有２０％的乡和４０％的村没有进行大检查工作。三是条块之间不平衡，地方党委、政府的动作大一些，认真部署了检查，抓好紧一些；相对来说，有些部门行动慢一些，没有真正对涉农项目下大力气清理。
（二）仍有一些违反中央政策规定的问题没有解决。有些地方对检查中发现的问题没有及时解决，对此，农民还有意见。
１．乱集资仍很突出。一是从各地反映情况看，一些地方仍在向农民进行教育集资，没有按规定停下来。甘肃省安西县布隆吉乡１９９９年向农民每人收取教育集资４５元。湖北省大悟县有的乡镇直到１９９９年底还在收取教育集资，农民人均１７元。四川省溪县和简阳市已没有中小学危房改造任务，但仍在审批和进行教育集资。河南省南阳市宛城区溧河乡为缓解建校资金不足，擅自向在校生每人收取１００元借款，变相搞集资。二是借农村电网改造之机搞集资。农村电网改造本是一件利国利民的好事，但有的地方借此向农民乱集资、乱收费。湖南省张家界市永定区的个别乡镇，在开展农村电网改造的过程中，借换电表、装入户线之机变相集资，每户少则一二百元，多则几百元。此外，道路集资、合作医疗集资在一些地方仍未禁止。
２．乱收费仍较严重。一是中小学校乱收费。中小学校乱收费是农民反映突出的问题，虽经多次治理，但在一些地方仍很严重。河南省襄城县山头店乡一中违反规定收取择校生费，每个学生每学期１３０元。贵州省遵义市、黔西南州有一半县存在农村中小学乱收费问题。贵州、湖南两省的部分学校还向学生收取垃圾费、建档入机费、政府办学费、留级费等花样翻新的项目。四川省南溪县和简阳市一些学校去年向学生收费，小学生３００－－４００元，中学生４００－６００元，相当于农户家庭上交提留统筹费的几倍。二是农村建房乱收费。农村建房方面的乱收费在一些地方仍比较突出。四川省简阳市金马镇全胜村农民新建住房，要向有关单位交纳９种税费。湖北省大冶市城建部门把面向城镇收取的市政配套设施费扩大到农村，按每平方米３０元收取。三是计划生育乱收费。一些地方计划生育乱收费仍屡禁不止。四川省一些地方办理计划生育指标，一对夫妇要收１５０元，属于超标准收费。湖南省张家界市永定区三岔乡，要求外出务工的农民在办理流动人口计生证明时，交工本费３０元，而且要求一年一换。此外，结婚登记搭车收费现象在不少地方仍然存在。
