三级中西医结合医院是中西医结合临床研究的重要力量，不但要承担中西医结合临床应用研究，还应围绕临床关键问题加强中西医结合基础和理论研究，逐步成为中西医结合临床研究的主体。
二、原则和方法
中西医结合临床研究应围绕临床需求，紧密结合临床工作，重视临床诊疗数据积累，探索和提炼中医、西医方法在疾病发展不同阶段的应用指征、联合应用的时机及合并症应用的选择，寻求中西医结合的最佳形式与时机，研究中西医结合最佳诊疗方案。
采用辨病与辨证相结合、宏观与微观相结合的研究思路，强化中医药理论指导、以多学科协作及方法应用为手段，以提高临床疗效为核心，探索中西医结合临床研究模式，促进中西医结合学术创新。
三、方向和重点
围绕临床常见病、多发病以及严重危害人类健康的重大、疑难疾病，结合医院确有疗效的诊疗方法和技术，开展临床研究。
研究中西医结合临床诊疗方案和临床路径，提炼总结中西医结合优势突出的病种的诊疗规律和模式，研究建立科学合理的疾病疗效评价方法和体系。
继承传统中医药精华，重视名家学术经验传承研究，开展临床疗效明显的经验方和特色制剂的研制及开发应用研究。
针对临床关键问题开展中西医结合基础研究，揭示中西医结合防治疾病的作用规律和疗效机理，为疾病的防治提供新的思路与方法，推动中西医结合在理论上的创新与突破。
促进临床研究成果转化，形成具有中西医结合特色的诊疗方法、技术和药物，积极应用和推广。
四、科研管理
围绕本院中西医结合临床研究目标，制定体现中西医结合优势的研究工作规划和年度计划，保证规划和计划的组织实施和落实。
建立符合中西医结合科学研究规律和发展的各项管理制度，包括课题申报、评审立项、过程管理、实验记录、经费使用、资料归档、考核奖惩、成果鉴定及验收等，通过制度和机制保障促进中西医结合临床研究高效运行。
创造良好的科技创新环境，鼓励和吸引多学科高端人才参与中西医结合临床及应用基础研究，保持、培养和造就结构合理、高素质、高水平的中西医结合专兼职临床研究人才队伍。
加强中西医结合临床研究平台建设，提供能满足临床需求的科研服务。抓好研究室（所）、实验室的规划和建设，有条件的医院争取创建省部级以上的重点研究室和实验室。
拓展符合中西医结合医院特点的临床成果转化途径，展现中西医结合的技术创新与临床成果，促进中西医结合新技术、新方法、新药物的临床推广使用。
五、考评和激励
健全科研业绩考评制度，建立符合中西医学结合特点的临床和科研相结合的综合绩效考核体系。根据从事研究工作量和研究成绩（包括学术论文、科技奖励、科技成果、承担项目、申请专利、成果转化等），建立结果考核与过程评价相统一、业绩考核与奖惩紧密挂钩的业绩考核制度。加强科研激励机制，制定有利于中西医结合临床研究的科研优惠和奖励政策。
第六部分 药事管理
中西医结合医院的药事管理以提供安全洁净、质量可靠、调剂科学的中西药物为核心，以满足临床需要为宗旨。
一、药房设置
中西医结合医院的药房包括中药房、中成药房和西药房。中成药房和西药房可以设在一起，但应分区域，面积符合规定，并满足医院临床需要。
中药房设置达到《医院中药房基本标准》，应设有中药饮片库房、中药饮片调剂室、中成药库房、中成药调剂室、周转库、中药煎药室。中药房应当远离各种污染源，有有效的通风、除尘、防积水以及消防等设施。中药房、中成药房、中药饮片调剂室面积应当与医院的规模和业务需求相适应。中药饮片调剂室面积，不低于100平方米；中成药调剂室面积，不低于60平方米。中药房的设备（器具）应当与医院的规模和业务需求相适应。中药房主任或副主任中，应有副主任中药师以上专业技术职务任职资格。中药饮片质量验收负责人应为具有中级以上专业技术职务任职资格和中药饮片鉴别经验的人员或具有丰富中药饮片鉴别经验的老药工。中药饮片调剂复核人员应具有主管中药师以上专业技术职务任职资格。煎药室负责人应为具有中药师以上专业技术职务任职资格的人员，煎药人员须为中药学专业人员或经过中医药管理部门、学术团体或医院等部门培训后取得相应资格的人员。
