（一）边境维护和管理。包括国门建设及其周边环境整治，界桩、界碑的树立和维护，界河河堤及河道整治，边境管控等。
（二）改善边境地区民生。包括基层政权建设、教育、文化、卫生等社会事业，以及改善边民生产生活条件等民生事项。
（三）促进边境贸易发展和边境小额贸易企业能力建设。包括边境一类口岸运转，通关条件改善，边贸仓储、交通等基础设施建设；为边贸企业创造良好的生产经营环境，安排贷款贴息，支持企业技术培训、科研、创新、人才引进、提升服务水平等能力建设。
第四条 边境地区专项转移支付资金的管理应当遵循以下原则：
（一）突出重点。资金重点用于解决边境地区承担的中央事权、具有区域特点的支出责任，以及社会经济发展中存在的突出问题。
（二）公开透明。资金使用和项目选择应当按照财政规章制度进行，纳入政务公开范围。
（三）注重实效。坚持办实事、重实效，主要以社会效益为目标，强化绩效考评。
（四）专款专用。资金不得截留或挪做他用，不得用于平衡预算。
第五条 边境地区专项转移支付资金的使用实行分级管理。省以下各级财政部门的管理职责由省、自治区、计划单列市财政部门（以下统称省级财政部门）研究确定。
第六条 财政部负责制定边境地区专项转移支付资金管理政策，分配、下达转移支付资金，组织实施对省级财政部门管理和使用转移支付资金情况的绩效评价和监督检查。
第七条 省级财政部门负责制定本地区边境地区专项转移支付政策，向省以下财政部门分配、下达转移支付资金；组织实施对省以下财政部门管理和使用转移支付资金的绩效评价和监督检查。
第八条 省以下财政部门负责管理、安排和使用本地区边境地区专项转移支付资金。
第九条 中央财政在年度预算中安排边境地区专项转移支付资金，其中专项用于支持边境贸易发展和边境小额贸易企业能力建设的转移支付资金实行与口岸过货量等因素挂钩的适度增长机制。省级财政可以根据本地区实际情况，安排资金与中央财政下达的专项转移支付资金一并使用。边境地区专项转移支付资金不要求县级财政配套。
